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【喜报】翼和PCR-LDR协助客户又发SCI文章

文献来源:Cai MY, Cheng J, Zhou MY, Liang LL, Lian SM, Xie XS, Xu S, Liu XG, Xiong XD. The association between pre-miR27a rs895819 polymorhphism and myocardial infarction risk in a Chinese Han population. Lipids in Health and Disease, 2018,17:7 doi 10.1186/s12944-017-0652-x

背景知识 越来越多的证据表明,miRNA直接或间接的参与了大量的生物学过程,并且与多种人类疾病密切关联,例如心血管疾病。在前体miRNA(pri/pre-miRNA)中的SNP位点能够影响miRNA识别和结合靶基因的能力。根据前人的报道,miR-27a、miR-26a-1、miR1000、miR-126和miR-218等与心肌梗死(MI)的病理关联。

技术手段 为了评估在这些前体miRNA中的5个多态性位点与中国汉族人群个体中潜在的关联,作者采用了PCR-LDR的方法在287例心肌梗死病人和646个对照组样本中检测5个多态性位点的SNP分型。并用SPSS软件分析了SNP位点与MI风险的关联性。(其中,PCR-LDR法SNP分型在上海翼和完成)

主要结果

多态性位点与MI风险关联分析

作者对MI影响因素进行样本的特征分析,病例组和对照组之间进行双侧T检验,结果发现,男性、吸烟、喝酒、高血压患者、高脂血症、糖尿病、空腹高血糖、高甘油三酯和LDL-C等,患心肌梗死的概率高。

通过风险值估计、置信区间和哈温检测,作者发现pre-miR27a的rs895819位点,AG杂合子或者AA纯合子相比GG纯合子患MI的风险更低。并且将该位点的AG和AA基因型混合后相对于GG类型,混合后的样本分组仍然患MI的风险更低。然而在其他4个前体miRNA的SNP在等位基因和建立的遗传模型中并没有发现与MI的显著关联。

 

前体miR-27a rs895819位点患病风险的分层分析

作者对具有患MI风险的前体miR27a rs895819位点进行了分层分析,结果如表3所示,在AG+AA基因型组中,排除喝酒因素外,年轻化、男性和吸烟都明显的降低了患心肌梗死的风险。

 

前体miR-27a rs895819位点与血脂谱的多元关联

Rs895819可能通过调控血脂代谢而起到影响患MI的效应,因此作者还对前体miR-27a rs895819多态性位点对血脂谱进行了多元关联分析,结果表明,AG和AA基因型相比于GG基因型具有更高HDL-C。

结论:本文结果表明前体miR27a的rs895819多态性位点在中国汉族人群中与MI显著相关,可能是通过影响HDL-C的水平进而影响患MI的几率。

评语:作者通过对病例组和对照组的基因分型,并且对病例组的各种因素如年龄、性别、是否吸烟、喝酒等进行了调查,使得分析的结果多样化,更加有意思。根据初步定位得到的风险值估计和关联分析结果,进一步进行多元分析,并与血脂谱各项指标进行关联分析,从而对其功能模式进行推测。这样就使得全文的逻辑层次分明,更加完整,是比较经典的SNP研究模式。

 

号外:上海翼和的PCR-LDR分型技术是已经开发成熟的技术方案,至今已经协助客户发表包括Nature Genetics在内的多篇SCI论文。你还在等什么,快快戳我们联系吧。

 

 

目前翼和业务领域涵盖靶向捕获二代测序、细胞系STR遗传背景鉴定和SNP基因分型三大板块。在基因检测应用中,公司采用TaqMan、LDR与等位基因PCR技术,为客户提供高性价比的服务。翼和专家团队将继续秉承“专业、协作、进取”的企业精神,致力于应用遗传学诊断技术服务人类健康、推动生命科学相关研究发展。

翼和服务

随着遗传学越来越贴近老百姓的生活,上海翼和生物作为历史悠久的遗传学服务供应商,有14年高性价比的专业基因检测经验,推出了全方位的SNP分型平台,提供各类基因检测和科研委托服务,检测技术包括①TaqMan荧光探针技术;②自主知识产权的PCR-LDR技术;③基于超高重PCR捕获的二代测序SNP分型平台(Hi-SNP);④基因组目标区段的超高重PCR捕获建库测序平台(Hi-reseq)。

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