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翼和细胞STR鉴定-专业服务!金牌品质!

茜美人 上海翼和生物 2月21日

本期嘉宾

细胞鉴定

细胞系STR遗传质量鉴定是上海翼和自2014年起开始推出的专业服务,翼和是国内最早一批开展细胞系STR遗传质量鉴定服务的公司,迄今为止已有五年的细胞STR鉴定服务经验,十余年的STR分型经验。翼和细胞STR鉴定以专业的服务,金牌的品质,受到广大客户的一致好评!

在刚刚过去的2018年,翼和细胞STR鉴定产品线的用户发表近20篇高水平SCI论文,其中包括EMBO Mol Med,Cancer Res,Mol Cancer,elife等顶级期刊,5分以上的文章12篇(如下表所示)。这有力地说明了翼和细胞STR鉴定结果是得到国际顶级期刊认可的!

   细胞系鉴定   

所谓细胞系鉴定即通过STR(短串联重复)图谱所建立细胞系的遗传特征。一株细胞系的遗传特征确立后,细胞系可以通过定期的检测,以防止出现细胞系被误认或交叉污染的情况。

什么时候需细胞系鉴定?

·      当建立或获得一个新的细胞系时;

·      一个涉及到细胞试验项目开始/结束时

·      在细胞冻存之前,或细胞已连续培养2~3个月时

·      发表文章或申请课题经费前

·      细胞系表现不稳定或结果与预期差别较大时

·      当实验室使用超过一种细胞系时,所有细胞系最好先鉴定以排除交叉污染的可能

 如何进行细胞系鉴定?

细胞系鉴定目前主要依据国际身份认证委员会的标准。依据该标准,可以通过多重荧光PCR技术,对人源8个STR位点以及1个性别决定位点进行检测。下表为这些位点的遗传信息。

上海翼和生物是上海市遗传学会理事单位、翼和专家是ATCC国际细胞系认证委员会成员。翼和采用更高分辨率的20个STR鉴定位点,包括上述8个国际标准STR位点和1个性别鉴定位点之外,额外的11个STR位点可以辅助进行结果判断。

STR 基因座位上的等位基因可通过扩增区域内重复序列的拷贝数的不同来区分,在毛细管电泳分离之后可通过荧光检测来识别。然后通过一定的计算方法,即可根据所得的STR分型结果与细胞STR数据库比对从而推算出样品所属的细胞系或可能的交叉污染的细胞系名称。

翼和采用DSMZ tools进行细胞系比对,其中包含来自于ATCC, DSMZ, JCRB 和 RIKEN数据库的2455个细胞系STR数据。如果待检测细胞未收录于以上细胞库或这是自行建立的新细胞系将无法进行比对,用户需根据细胞分型结果自行与其他数据库进行比对。

翼和细胞STR鉴定项目流程

翼和提供的专业STR鉴定结题报告包括:细胞身份验证报告、STR等位基因表、电泳图、结果的解释与数据库比对结果。就这一服务本身而言,是非常专业的!

FAQ TOP2

如何根据细胞STR鉴定结果判断细胞系是否发生了交叉污染?

如果存在细胞系之间发生交叉污染,而且鉴定用的细胞可能有两种以上的细胞系时,那么在进行STR位点检测的时候,多个位点会出现两个以上的峰。峰高值表示该等位基因的信号强度,理论上峰值与样本的DNA浓度有直接的关系。因此,存在交叉污染的混合细胞系中,其中一个位点中某些峰会明显高于其他的峰,其中大峰是属于混合细胞系中那个主要细胞系,而小峰则属于那个次要细胞系。

值得注意的是,当发生两个或以上细胞混合的时候,检测结果看起来非常像细胞系的“遗传不稳定”——当一个细胞系存在亚群时,尤其是一些癌细胞系,由于遗传不稳定的存在,在一些位点的STR特性会不同。因此经验丰富的分子专家是非常重要的,他能够帮助分析复杂的电泳图谱(STR峰图),从而判断是否由于发生细胞系交叉污染而导致多等位基因情况。上海翼和应用生物,作为老牌的遗传技术服务公司,十年以上基因分型经验,可以帮您解决疑惑。

如何根据STR数据判断细胞系的身份?

收到细胞系鉴定结果以及STR信息,可以与参考数据库进行比对。如果细胞样本的每个STR位点和参考细胞STR位点都能重合匹配,即说明该细胞系正确,反之则说明你的细胞系可能被错误标记,交叉污染或发生遗传不稳定。一般说来,匹配度≥80%即可认为该细胞系正确,匹配度<80%则说明该细胞系的来源需要被怀疑。

如果细胞系被鉴定出发生交叉污染或错误标记,则需要拿更早代数的细胞进行鉴定,从而找到问题的起源或者直接从可靠的机构购买一株新的细胞系。

 

最专业的细胞STR鉴定哪里找?

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上海翼和应用生物技术有限公司

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