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【喜报】恭喜翼和生物客户研究论文发表Oncotarget

【喜报】恭喜翼和生物客户研究论文发表Oncotarget


 

  

恭喜上海翼和生物客户镇江市第一人民医院心胸外科发表研究论文于OncotargetIF=5,论文标题为Polymorphisms of VDR gene and risk of gastric cardiac adenocarcinoma in Chinese population上海翼和生物为其中SNP基因分型提供分型服务。

文献来源doi: 10.18632/oncotarget.17270


1 

维生素D受体VDR基因的多态性已经被报道和某些肿瘤的易感性增加相关,但是对贲门腺癌GCA的易感性影响目前上没有定论。

作者分别采集了病例和对照组样本,选择VDR基因中4SNP位点与门腺癌易感性进行研究。作者选择连接酶检测反应来对所有样本的SNP位点进行分型(上海翼和生物为其提供SNP基因分型服务),发现单独SNPGCA的发病风险没有相关性,但是进一步进行单倍型分析,发现Trs2107301Trs2228570Crs1989969Grs11568820单倍型将降低易感性。

2   

前期已经有大量证据表明VDR与癌症具有相关性,VDR表达的增加对不同类型癌症的预后效果较好。早期文献报告,VDR (ApaI [rs7975232], BsmI [rs1544410], FokI[rs10735810], TaqI [rs731236] 4个位点与癌症风险相关。并且作者通过早期研究,推测这四个位点也与GCA有关。

3   

作者选择VDR (ApaI [rs7975232], BsmI [rs1544410], FokI[rs10735810], TaqI [rs731236] 4SNP位点,在330case608control中进行SNP基因分型。

01

SNP位点与GCA风险的相关性。

 

通过对单个SNP位点分性结果的分析,结果发现于GCA的风险并无相关性。

02

SNP位点与GCA风险的分类分析。

 

由于单个位点在整体样本中并无相关性,因此作者将样本根据不同性别,年龄,是否抽烟等进行分类分析,结果发现VDR rs1989969位点的多态性在年龄<60岁的饮酒人群中,会增加GCA的风险。

03VDR SNP位点单倍型分析与GCA的易感相关性。

作者发现VDR Trs2107301Crs2228570Crs1989969) Grs11568820 casecontrol样本中最常见的单倍型,Trs2107301Trs2228570Crs1989969

Grs11568820 则在control样本出现的频率高于case样本,并且具有显著差异。因此作者认为Trs2107301Trs2228570) Crs1989969Grs11568820单倍型将会显著降低GCA的发病风险。

后记

这个时候,让小E想起了早前分享的一篇文献,作者选择的多个SNP位点进行分型,结果单独位点分析发现和疾病并无相关性,但是后期通过进一步的单倍型分析,发现其中一单倍型会显著降低疾病的发病风险。

(喜报)LincRNA多态性与CAD易感性的相关性

PCR-LDR SNP分型平台

上海翼和生物专利技术PCR-LDR分型方法,拥有十二年分型经验,每年协助客户发表研究论文,包括“Nature Genetics”等期刊,在客户中形成良好口碑。

PCR-LDR分型原理:

 

 

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