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【重视】国内细胞系污染情况不容忽视

【重视】国内细胞系污染情况不容忽视

 

前文回顾

大家还记不记得小E去年曾经发表过一篇文章,中国科学院昆明细胞库检查了多株细胞,结果发现数十株细胞结果被证实其实Hela细胞,并且另有数十株细胞同样被错误鉴定为其他细胞。感兴趣的伙伴们可以翻阅:一切由细胞身份开始说起

 

刚真的,小E同学之所以会在在上海翼和生物里发表了多篇关于细胞系错误鉴定或者细胞系交叉污染的文章,主要目的还是希望所有在细胞生物领域的伙伴们能够重视这类问题,做到防范于未然。所幸的是,目前越来越多的单位已经开始重视起这个问题,2017年,武汉大学病毒学国家重点实验室发表了一篇文章,主题便是278株常见人源肿瘤细胞系的交叉污染及错误鉴定,该实验室采用STR分型方法进行细胞系遗传背景鉴定,结果得到了一个可怕的结果。

参考文献:Investigation of Cross-Contamination and Misidentification of 278 Widely Used Tumor Cell Lines

DOI:10.1371/journal.pone.0170384

作者分别从国内28个研究机构搜集了278株常见人源肿瘤细胞系,其中国内建立的细胞系71株,国外建立的细胞系207株。经STR鉴定后发现,来自于22个研究机构的128株细胞存在交叉污染/错误鉴定的情况,错误率高达46%。其中国内建立的细胞系占52株,这表明了什么,国内建立的细胞系交叉污染/错误鉴定率竟然高达73.2%,并且67.3%35/52国内交叉污染/错误鉴定的细胞系结果被证实是Hela细胞或被Hela细胞部分污染的! 

 

 

国内研究机构搜集细胞系错误率统计

E内心是崩溃的,我一直知道细胞系污染是一直存在的问题,但是没想到国内细胞系污染的情况会那么严重,国内来源的细胞,正确率竟然不到30%

在这据统计,128株错误细胞系中,其中交叉污染细胞系占84.8%108/128,其余为错误鉴定细胞系。从国内/国外来源细胞的情况统计结果看,Hela细胞的绝对搅屎棍地位不容撼动!

 

 

国外来源细胞系交叉污染情况统计

 

国内来源细胞系交叉污染情况统计

 

一切由细胞身份开始说起一文中,小E已经为大家罗列出目前已经确定被Hela细胞污染的细胞系名称。做细胞实验的伙伴们可以翻阅一下,以防自己的细胞也在其中!

还不仅仅如此,这些常见的细胞系除了发现种属内的交叉污染/错误鉴定,还有部分细胞系被发现连种属都被错误鉴定了!被鉴定的278株细胞系中,有2020/278=7.2%细胞系PCR扩增失败,证明其并非人源细胞。作者继续跟踪实验,通过种属鉴定来确认其真实来源,结果其中2株细胞系被证实分别来源于大鼠和小鼠,另有14株细胞无法判别其种属来源。

 

上海翼和生物细胞系STR鉴定

STRShort TandemRepeat,短串联重复序列)基因分型已被ICLACATCC等权威机构作为金标准应用于细胞鉴定 。上海翼和生物除了采用ATCC检测的8STR1个性别决定位点Amelogenin外,另新增了11个高度多态性位点 ,检测20个位点来进行人源细胞系背景鉴定,力求将鉴定做到更全面,更专业。

 

 

鉴定流程:细胞DNA抽提——荧光引物PCR扩增STR位点——扩增产物3730XL测序仪电泳获得分型结果——国际细胞STR数据库结果比对——报告发放

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