肿瘤样本低频突变检测
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肿瘤组织DNA低频突变检测服务

实验目标:通过二代深度测序,了解肿瘤样本中各类低频突变的位置、碱基变化和相对比例。

实验样本:各类肿瘤组织抽提的DNA、各类肿瘤石蜡样本抽提的DNA。不包括血液中的游离肿瘤DNA。

测序深度:每个被测区段,平均测序深度达到5k-20k;所有被测区段中,最低测序深度达到200-800倍。

检测灵敏度:1%-5%的低频突变可被有效检出。

总体样本要求

1、若样品为基因组DNA,要求:DNA浓度≥20ng/ul,体积>20ul。纯度OD 260/OD280 在1.8~2.0之间。

2、若分型样品为肿瘤组织,要求肿瘤细胞比例>10%,送样过程中请注意保持低温,防止DNA降解。提取DNA将收取DNA提取费。

3、客户在寄送样品的时候,应在送样包裹中放置足量的冰袋,以减少在运输过程中因温度变化导致DNA降解的可能。

4、提供片段序列信息,被选区域可以是连续的基因组序列,也可以是独立片段或外显子序列。

结果提供

1、实验报告,含实验材料与方法,所用引物序列等等

2、结果汇总和基本分析,各样本中存在的肿瘤突变,测序深度以及注释等。

3、高级分析,公司可根据客户需求对数据进行分析,需客户提供参考文献依据。